掌上电脑的核心内容是操作系统，销售市场上的掌上电脑关键采用两大类操作系统：一类是日趋健全的Palm操作系统，应用Palm系统的掌上电脑在国际市场市场份额中占据65%以上，关键有Palm、IBM的Wkpad、Sony的Clie和TRGpro、hspring等palm电脑上，另一类则是微软公司Windows CE系列产品，尽管起步较晚，但早已突破了Palm OS一统天下的局势，并且因为Win CE受权较为普遍，中国绝大多数掌上电脑全是应用Win CE系统软件，包含中国的想到、方方正正及其外国的HP、COMPAQ等企业都是有Windows CE掌上电脑发布。做为两大操作系统，采用PalmOS的产品充电电池使用时间比采用Win CE的产品长；配备五颜六色显示器的产品沒有纯色显示器产品的充电电池使用时间长；在多媒体系统性能上，Win CE要比Palm好一些；并且操作面板与运用性能上，wince可以让使用者更易入门；此外，在手机软件的总数上，Palm要比Win CE多一些。

自然除上以上两大操作系统外，从全部国外市场看来，掌上电脑的操作系统也有Pocket PC、EPOC、Hopen、Penbex和Linux操作系统。

三大势力

操作系统可以分成三大势力：Linux OS，Palm OS， Windows Mobile(Pocket PC)。Palm采用PalmOS系统软件，由Palm企业开发设计；而PocketPC采用WinCE的系列产品系统软件，由微软公司开发设计。由于人体性能及操作系统的区别，这二种人体或是有非常的差距的。

LinuxOS多见于光电记事簿，虽然是光电记事簿却也多多少少添加了许多智能化原素，也算得上掌上电脑的开山鼻祖，普遍型号：商务通 知名人士 SHARP文曲星好易通这些，总而言之玩掌上电脑的此前全是玩光电记事簿的， 但是它种类过于复杂沒有规范欠缺持续性和可铸就性，只有一年换一台，真的是名不实际上的记事簿。

应用Palm OS的Palm和使用微软公司Windows Mobile的Pocket PC(PPC)。PPC采用的是苹果公司的操作系统，从WINCE一直到今的WINDOWS MOBLIE 5.0，PPC干预PDA時间要短于PALM，可是凭着其操作系统的便捷性（和windows桌面系统十分像）快速的被大伙儿接纳，并且价钱亦和PALM相差无异，因此其市场占有率快速扩张。

PPC一般采用快速CPU，一般都是200MHz以上，（于其系统软件容积非常大），多媒体系统作用较为强悍，全部产品均采用显示屏设计方案，合适群体较为宽阔。可是缺陷也是十分显著，待电時间较为短，因为其强悍的CPU和智能作用均是吃电大户人家，尽管历经十几年的改善，其电池电量持续扩大，可是待电時间却无明显增强，一般一台新的PPC在充斥着电时，一次性可以连续运作5－7个钟头上下（视个别差异而别）。

奔迈PALM，发生较为早，初期时作用非常简单，仅仅储存一些私人信息，但却快速的领起一股风潮，风靡了南美洲和欧洲地区。因为早期产品不重视多媒体系统，因此CPU速率较为低一般都是在33MHz之内，可是在其系统软件层面一点也不比PPC弱（由于系统软件体型小，并且运作规定低）。